@jampei2

Ph.D., D.V.M., Professor at U. Osaka. AI for viral infectious diseases. 大阪大学 微生物病研究所 附属バイオインフォマティクスセンター 教授

 Osaka, Japan
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Joined November 2018
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JSDB
@_JSDB_Oct 23
大阪大学 微生物病研究所 生体統御分野（石谷研究室）研究員募集 【応募締切】2026年12月31日必着 ※適任者の採用が決まり次第、募集を締め切ります。 jsdb.jp/blog/article.html?pa…
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DRY解析をはじめるときに必須の「環境構築」を実験医学最新号で解説しています！ 引用のデータ解析系書籍で勉強する前に、おすすめの特集です💻 condaやmambaを自機へ導入するために必要な基礎知識を、15分で読めるボリュームでまとめています。 この記事の概論を、〜10月26日まで限定で0円購読できます↓ yodosha.co.jp/jikkenigaku/ar…
羊土社 実験医学
@Yodosha_EMOct 1
データ解析系の書籍を集めてきました🏃‍♀️📚 求める目的やレベルに合わせて選べます
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感染病態分野の山本 雅裕教授が第44回(令和8年度) #大阪科学賞 を受賞しました。 受賞研究テーマは「病原体とがん免疫系間の相互作用の研究およびその革新的解析技術の開発」です。 biken.osaka-u.ac.jp/news_top… #大阪大学 #微生物病研究所 #RIMD #微研 #びけん #阪大 #UOsaka #基礎研究
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微生物制御学分野の藤本 康介教授が「日本医師会医学研究奨励賞（Medical Research Encouragement Prize of The Japan Medical Association）」を受賞しました。 biken.osaka-u.ac.jp/news_top… #大阪大学 #微生物病研究所 #RIMD #微研 #びけん #阪大 #UOsaka #基礎研究
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免疫化学分野の荒瀬 尚教授が2026年度武田医学賞を受賞しました。 受章テーマは「宿主―病原体相互作用に基づく疾患発症機構の解明」です。 biken.osaka-u.ac.jp/news_top… #大阪大学 #微生物病研究所 #RIMD #微研 #びけん #阪大 #UOsaka #基礎研究
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エゾウイルスを媒介するマダニを実験的に検証したプレプリントが公開されました。エゾウイルスは2019年に見つかって以降、様々なマダニから見つかっていますが、どのマダニが媒介するか不明なままで、状況証拠しかありませんでした。今回、シュルツェマダニが特に媒介能が強いと示すことができました。
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Naoki Konno@utnk1Sep 18
Here is the English version of the flyer!
Naoki Konno@utnk1Sep 18
こちらの国際シンポを年会幹事の先生方と企画させて頂いています。海外ゲストとして、ゲノム言語モデルEvoの開発チームを率いていらっしゃる @BrianHie , SeqHubなどゲノム微生物学の言語モデル活用で有名な@tatta_bio のCEO, @ancornman1 にご来日・講演頂けることになりました！日本からも↓
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Naoki Konno@utnk1Sep 18
こちらの国際シンポを年会幹事の先生方と企画させて頂いています。海外ゲストとして、ゲノム言語モデルEvoの開発チームを率いていらっしゃる @BrianHie , SeqHubなどゲノム微生物学の言語モデル活用で有名な@tatta_bio のCEO, @ancornman1 にご来日・講演頂けることになりました！日本からも↓
Hiroshi Mori@Tyu_ShiSep 18
非会員でも国際シンポジウムをオンライン視聴できる参加枠（有料）を用意しておりますので、学会会員非会員に関わらず微生物分野の生成AI研究の最前線にご興味がおありの方はご参加いただけますと幸いです。smartconf.jp/content/sgmj27/…
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Hiroshi Mori@Tyu_ShiSep 18
非会員でも国際シンポジウムをオンライン視聴できる参加枠（有料）を用意しておりますので、学会会員非会員に関わらず微生物分野の生成AI研究の最前線にご興味がおありの方はご参加いただけますと幸いです。smartconf.jp/content/sgmj27/…
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The Article from Watanabe Lab was published in Nature Communications. "A divergent betacoronavirus with a functional furin cleavage site in South American bats " biken.osaka-u.ac.jp/en/achie… DOI： 10.1038/s41467-026-77599-6 #TheUniversityOfOsaka #UOsaka #RIMD #betacoronavirus
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渡辺研の研究成果がNature Communicationsに公開されました。 南米のコウモリから新たなベータコロナウイルスを発見 biken.osaka-u.ac.jp/achievem… DOI： 10.1038/s41467-026-77599-6 #阪大 #微研 #RIMD #ベータコロナウイルス #コウモリ
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【研究者公募のお知らせ】 国立遺伝学研究所では、新分野創造研究系（DFR）のテニュアトラック准教授を3名程度公募します。「独自のアイデアで、生命科学の世界に新しい分野を切り拓きたい！」という意欲を持つ若手研究者を歓迎します。 nig.ac.jp/career/15165/

国立遺伝学研究所 テニュアトラック准教授募集要項　応募締切：2026年11月30日(月)正午必着 | 国立遺伝学研究所

募集要項：PDF  提出書類：応募者概略(excel) 推薦書送付方法 和文：PDF  推薦書送付方法 英文：PDF  １ 募集内容 　国立遺伝学研究所（遺伝研）では新分野創造研究系（DFR）のテニュアトラック准教授を３名程度公募します。任用条件は、「独自の...

nig.ac.jp
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新型コロナワクチンについて、さとう内科・脳神経クリニックさん @satohnc と共同研究させていただきます。 今年は12〜17歳の未成年も対象とさせていただく予定になっています。ご興味ある方は、ぜひご参加をよろしくお願いいたします🙏🏻 #拡散希望
さとう内科・脳神経クリニック
@satohncSep 7
東京大学医科学研究所　佐藤佳教授「呼吸器感染症患者検体を用いた免疫学的解析」 12-17歳以上の募集を開始します 以下Googleフォームよりご応募ください forms.gle/J3oiKztMfVpwhMYz7 対象：12-17歳（接種日当日に12歳以上） 接種歴、感染歴をご準備下さい 募集期間は9/12（土）23:59まで 対象者には翌週中にXのDMよりご連絡いたします 対象ワクチン：ファイザーコミナティXFG株 接種費用：15,000円（税込み） 謝礼： ・ラボ特製デザインの図書カード5,000円分 ・QUOカード7,000円分 ・ご希望の方に中和抗体価の個別通知 ・ご希望の方に論文掲載後に掲載論文と、サンクスレター ・東京大学医科学研究所システムウイルス学分野のラボ見学ツアーへご招待、未確定ですが2027年3/27,28予定 接種と1回目の採血は10/4（日）からスタート 2回目の採血は10/25（日）以後 各回採血日は複数の選択肢があります 応募は一人1回まで 同一の方からの複数応募は応募自体を無効とします いたずら入力はご遠慮ください 応募状況によっては締切を短縮もしくは延長する場合があります お問い合わせはDMからのみお願いします インフルエンザワクチン同時接種可
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渡辺研の研究成果がNew England Journal of Medicineに公開されました。 新しい不活化エボラワクチン「iEvac-Z」の第I 相臨床試験で安全性と免疫原性を確認 ― 世界初、遺伝子欠損エボラウイルスを用いたヒト臨床試験 ― DOI： 10.1056/NEJMc2518666 biken.osaka-u.ac.jp/achievem… #阪大 #微研 #RIMD
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The Article from Watanabe Lab was published in New England Journal of Medicine. "iEvac-Z, an Inactivated Ebola Vaccine: Phase 1 Trial in Japan " DOI： 10.1056/NEJMc2518666 biken.osaka-u.ac.jp/en/achie… #TheUniversityOfOsaka #UOsaka #RIMD
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🚨 JOB ALERT🚨 We are very excited to be hiring the lab's ✨very first postdoc✨! Work on new AI technologies for decoding antigen protein evolution in a fresh research environment, at the heart of Paris 🇫🇷 Details & link to apply: research.pasteur.fr/en/job/p… Deadline: Sep 1st
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【生命情報科学若手の会第24回セミナーのお知らせ】 北里大学より齋藤裕先生をお招きし、AIによるバイオ分子設計のための技術についてご講演いただきます。 いよいよ明日になりました！ 日時: 7/18(土) 17:00-18:00（終了後オンライン懇親会） 参加登録→ forms.gle/zdy2RqViYHmsCCna7

第24回セミナー　参加登録　齋藤裕先生 (北里大学　産総研　東京大学)

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Inaugural post! We are a new lab at Institut Pasteur studying how pathogen antigens evolve and how we can exploit these proteins' evolution to make better vaccines! Read a few words from the currently sole member of the lab @SpyrosLytras below! 😁 pasteur.fr/en/research-journ…
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［プレスリリース］RNAスプライシング予測のための深層学習モデル「SpliceSelectNet」の開発 最大10万塩基対の長大なDNA配列からスプライス部位を予測し、がんや遺伝性疾患の原因となる異常スプライシングを検出できるモデル ims.u-tokyo.ac.jp/imsut/jp/a…
計算効率を保ちながら長距離の相互作用をモデル化し、予測の根拠となる機能的な配列重要度の可視化を実現

ALT 計算効率を保ちながら長距離の相互作用をモデル化し、予測の根拠となる機能的な配列重要度の可視化を実現

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タンパク質言語モデルの最新の動向についてJSBi Bioinformatics Reviewで日本語総説論文を書きました！ doi.org/10.11234/jsbibr.2026…

タンパク質言語モデルの発展と応用

自然言語処理分野で成功した大規模言語モデル（LLMs）の技術をタンパク質配列に適用したタンパク質言語モデル（pLMs）が、近年急速に発展している。従来のpLMsは主にスケーリング則に基づくモデルサイズの拡大による性能向上に依存していたが、配列情報から得られる知識の限界や、計算効率の問題、特定のタスク …

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松本@gggttaJun 1
Replying to @gggtta
総説1編目は、古井さん、大上さんによる「タンパク質言語モデルの発展と応用」です。以前にも本誌でタンパク質言語モデルの総説を掲載しましたが、本総説ではさらに発展著しいpLMsの近年の状況と今後の展望をさらにまとめていただきました。doi.org/10.11234/jsbibr.2026…

タンパク質言語モデルの発展と応用

自然言語処理分野で成功した大規模言語モデル（LLMs）の技術をタンパク質配列に適用したタンパク質言語モデル（pLMs）が、近年急速に発展している。従来のpLMsは主にスケーリング則に基づくモデルサイズの拡大による性能向上に依存していたが、配列情報から得られる知識の限界や、計算効率の問題、特定のタスク …

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