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Haruka Ozaki (尾崎遼)

@yuifu

⊿ Computational biology/Bioinformatics/Research automation. PhD. Tweet in Japanese. 理研と筑波大でバイオインフォと研究自動化のラボを主宰 Lab at RIKEN & Univ. Tsukuba: @ozakilab

 Tsukuba, Ibaraki, Japan
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Joined May 2009
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4/1より理化学研究所 生命機能科学研究センター @RIKEN_BDR で、AI生物学研究チームという研究室を始めます！ 「生命科学の研究現場にAIやロボットが普通にある日常」を研究していきます SPDR、学振PD/RPD/CPDの受入できます (下) HPはまだですが、[email protected]までお気軽にご相談ください
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FFPEなどの分解RNA用の微量total RNA-seqキット「GenNext Shin-RamDA-seq Kit for Degraded RNA with TNP」が東洋紡から発売されました。我々が開発したRT-RamDA法とRamDA-seqをベースにしています。ぜひお試しください。性能については以下のページで紹介しています。 lifescience.toyobo.co.jp/det… RT-RamDA法は、RNAを鋳型としてcDNAを合成すると同時に等温反応で線形増幅する独自技術です。原理はこちらの動画をご覧ください youtube.com/watch?v=zLSjAQyu…
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Keisuke Hirota@h160taNov 4
Our paper is out now in Genome Biology! We present EnzyREx, a deep learning framework for screening uncharacterized proteins against biochemical reactions, including those without known encoding genes (orphan reactions). (1/8) link.springer.com/article/10…
EnzyREx: deep learning enables reaction-based comprehensive enzyme screening

EnzyREx: deep learning enables reaction-based comprehensive enzyme screening

Genome Biology - Orphan enzymes for which the corresponding genes remain unidentified represent a major gap in functional annotation in genomic analysis. We present EnzyREx, an AI-based framework...

link.springer.com
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Genki Kanda
@Kd_GnNov 4
今月のLaboratory Automation月例勉強会のお知らせです 📅 2026年11月17日 [火] 📍 北海道大学 札幌キャンパス 🔹 材料・触媒化学のデジタル化 🔹 北大創薬センターにおけるラボオートメーション：機器測定と管理運用の実際 ⭐️ 上記2件のラボツアー 参加登録受付中です👇 laboratoryautomation.connpas…
Laboratory Automation月例勉強会 / 2026.11 (2026/11/17 13:00〜)

Laboratory Automation月例勉強会 / 2026.11 (2026/11/17 13:00〜)

## おしらせ [2026-11-01 14:48] 演題名を掲載しました。会場の情報を更新しました。 [2026-10-07 10:00] connpassを公開しました。 ## Laboratory Automation月例勉強会について Laboratory Automation月例勉強会では、ラボラトリーオートメーション（研究の自動化）に関するハードウェア・ソフトウェアはもちろんのこ...

laboratoryautomation.connpass.com
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Naoki Osada (長田直樹) (@Naoki_Osada) profile picture
Naoki Osada (長田直樹)@Naoki_OsadaOct 29
バイオインフォマティクス技術者認定試験の問題集が発行されました．問題だけではなく，解説が詳しく書かれているので知識をさらに深めることができます．遺伝・進化関連の問題も入っています． 多くの方に認定試験を受けていただけると嬉しいです．
JSBi (@npoJSBi) profile pictureJSBi@npoJSBiJun 12
バイオインフォマティクス技術者認定試験　公式問題集　出版（予定）のお知らせ かねてより要望のあったバイオインフォマティクス技術者認定試験の問題集を2026年10月（予定）に出版することになりましたのでご案内いたします。今後の受験勉強にぜひお役立て下さい。
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Ohue M/大上雅史 (@tonets) profile picture
Ohue M/大上雅史
@tonetsOct 28
アカデミアの有機合成化学者は "委託合成屋" にはなりたくないし、計算化学者は "委託解析屋" にはなりたくないよね。 終わり
叢雲くすり (創薬ちゃん) (@souyakuchan) profile picture叢雲くすり (創薬ちゃん)@souyakuchanOct 28
Replying to @souyakuchan
「アカデミアの有機合成化学者は "委託合成屋" にはなりたくない！」 談。 #cbi2026
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産総研の八木さん @takuma_yagi_ より『マルチモーダルモデル入門』をご恵贈いただきました✨ 豪華執筆陣により、マルチモーダル情報のノウハウや基盤モデルについて丁寧に解説されて読むのが楽しみです。 ラボ環境でのセンシングやロボット操作といった課題に活用できるよう勉強します…！
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Yuuya Nagata (@nagata_yuuya) profile picture
Yuuya Nagata@nagata_yuuyaOct 20
化学合成の自動化・自律化について情報共有の機会を作るため、「自動・自律化学合成分科会」を用意致します。後ほど参加希望者を募りますので、その際にはどうぞよろしくお願いいたします。
Genki Kanda (@Kd_Gn) profile pictureGenki Kanda
@Kd_GnOct 20
自動化学会（いわゆるLASA）では、月例勉強会と年会LADECを開催していますが、分科会もやっています NIMSの長田さん @nagata_yuuya のオーガナイズで「自動・自律化学合成分科会」が立ち上がりました 良い現場の会になると思います！ lasa.or.jp/sig/
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Genki Kanda
@Kd_GnOct 20
自動化学会（いわゆるLASA）では、月例勉強会と年会LADECを開催していますが、分科会もやっています NIMSの長田さん @nagata_yuuya のオーガナイズで「自動・自律化学合成分科会」が立ち上がりました 良い現場の会になると思います！ lasa.or.jp/sig/
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Genki Kanda (@Kd_Gn) profile picture
Genki Kanda
@Kd_GnOct 8
JST ARiSEの戦略ターゲット3（大型研究施設・研究装置）の採択課題になりました ひとつの実験を自動化することはかなり上手にできつつありますので、その先、Science by AIのための「施設」を作る技術開発をします 代表＋共同代表2＋分担1（@yuifu）の4チームでコンパクトに濃密に進めてゆきます
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Ohue M/大上雅史 (@tonets) profile picture
Ohue M/大上雅史
@tonetsOct 15
JSBiで問題集つくりました！認定試験受ける受けない問わず、ざっとバイオインフォマティクスを俯瞰できるようになっています。 問題集 keio-up.co.jp/book/b10203154… テキストはこちら keio-up.co.jp/np/isbn/978476…
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本日はトーゴーの日シンポジウム2026 biosciencedbc.jp/event/sympo…
トーゴーの日シンポジウム2026 - NBDC

トーゴーの日シンポジウム2026 - NBDC

2026年10月5日、東京・品川にて開催。生命科学分野のデータ統合にまつわる課題をともに考え、議論を深める場として開催します。

biosciencedbc.jp
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Atsushi SHIMIZU (@atsushi_ngs) profile picture
Atsushi SHIMIZU@atsushi_ngsOct 1
Epigenetic AI社のご厚意で東北大に寄付研究部門を設置しました。エピゲノムとゲノムコホートに専念していましたが、久々に比較ゲノム解析します。世界中の様々な動物とヒトを比較し、ヒトの疾患解明と動物の特殊な能力の解明、ゲノム科学的保全を目標とします。教員募集中。 megabank.tohoku.ac.jp/news/6…
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日本学術会議の公開シンポジウム「生命科学データのオープンな流通・活用の再構築－AI時代のデータ共有とガバナンスを考える－」を聴いてるけどとてもよいです AIによる科学の加速が進む中で、各分野にデータ基盤の大規模化・高度化が急務ということがわかります scj.go.jp/ja/event/2026/404-…
公開シンポジウム「生命科学データのオープンな流通・活用の再構築-AI時代のデータ共有とガバナンスを考える-」 | 一般公開イベント | 日本学術会議ウェブサイト

公開シンポジウム「生命科学データのオープンな流通・活用の再構築-AI時代のデータ共有とガバナンスを考える-」 | 一般公開イベント | 日本学術会議ウェブサイト

公開シンポジウム「生命科学データのオープンな流通・活用の再構築-AI時代のデータ共有とガバナンスを考える-」のイベント情報です。

scj.go.jp
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Tadayuki Akagi (@tadayuki_akagi) profile picture
Tadayuki Akagi@tadayuki_akagiSep 20
来春、大学院進学を考えている方へ。 キーエンス財団の大学院（修士課程）給付型奨学金、今年新設されました。月額12万円・2年間・返済不要。 締め切りは2026年11月13日（木）午前10時。 詳細はこちら👇 keyence-foundation.or.jp/sch… #奨学金 #大学院 #キーエンス財団
給付型奨学金 大学院（修士課程）対象｜キーエンス財団

給付型奨学金 大学院（修士課程）対象｜キーエンス財団

キーエンス財団は、返済不要の給付型奨学金で日本の未来を担う若者を応援します。給付額は月額12万円で大学院修士課程在学中の2年間を支援します。募集の対象は大学院の新1年生で、全学部の方に応募していただけます。

keyence-foundation.or.jp
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Yo Ehara (@yo_ehara) profile picture
Yo Ehara
@yo_eharaSep 20
査読をAIにやらせる問題、そもそも研究者が決められる話なんですかね？AIは知の産業革命みたいなもので、人間の査読はある種の職人芸で、学術はどの国でも基本的には公的資金で動いている。AI査読で大成功した学会が出てくれば、お金出す国の側から職人芸から産業革命対応への移行を促されるのでは？
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Haruka Ozaki (尾崎遼) retweeted
秋のカエルプリンセス (@suimye) profile picture
秋のカエルプリンセス@suimyeSep 19
[挑戦状] この度、TogoTVでは、（かってにカエル氏がおもってる）生命科学系データベースの文化祭、トーゴーの日（10/5）のプロモーションとして、ブロック崩しゲームを9/24まで行いますだにゃ！ハイスコアで俺を超えてみろだにゃ！togotv.dbcls.jp/pics-blocks.…
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Haruka Ozaki (尾崎遼) retweeted
福永　津嵩 (@fukunagaTsu) profile picture
福永　津嵩@fukunagaTsuSep 17
こういうご意見を複数いただきます。現在のAIが面白さを評価できないという点には同意しますが、そもそも本来はそうしたことを査読者が判定する必要はないと私は考えています。評価は出版後の研究コミュニティに委ねるべき、あるいはeditorの仕事であるはずです。
みっちー (@pomryo0708) profile pictureみっちー@pomryo0708Sep 17
今のAIは重箱の隅ばかり突いて面白さを評価できないからなぁ
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福永　津嵩 (@fukunagaTsu) profile picture
福永　津嵩@fukunagaTsuSep 16
Replying to @yamadagenki0607
シンギュラリティの定義がよくわからんからなんとも言えんが、査読はそんなに大したことではない気がする。
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Haruka Ozaki (尾崎遼) retweeted
福永　津嵩 (@fukunagaTsu) profile picture
福永　津嵩@fukunagaTsuSep 16
査読はなくては良いのではと思っていたが、最近は査読はAIで良い(Editorが最初からAIに投げれば良い)のではと思う。
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Jun Seita, MD, PhD (@jseita) profile picture
Jun Seita, MD, PhD@jseitaSep 2
私の「医科学データ共有開発ユニット」も受け入れ可能ラボの１つです。個人情報保護法・次世代医療基盤法に対応したAIや計算機基盤の開発に興味のある方は是非！
Shuichi Onami (@sonamix) profile pictureShuichi Onami@sonamixSep 2
理研は、研究分野での経験と、数理・計算科学・情報技術に関する高度なスキルを有し、研究者と協働して最先端の科学研究を推進する専門職「リサーチエンジニア」を育成する新プログラムを開始しました。リサーチエンジニアを目指す若手研究者の皆さん、奮ってご応募ください。riken.jp/careers/programs/re…
2027年度 理研リサーチエンジニア・フェロー 募集要項

2027年度 理研リサーチエンジニア・フェロー 募集要項

理研は、新たに「理研リサーチエンジニア・フェロー」を創設し、自らの研究経験と数理・計算科学・情報技術に関する高度なスキルを有し、それらを駆使しつつ、理研の研究者と協働して最先端の科学研究を推進する意欲を持つ若手研究人材を募集します。

riken.jp
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